在农村供水方面，以实施农村饮水安全巩固提升工程为主线，强化农村供水工程运行管护，着力提升农村集中供水率、自来水普及率、供水水质达标率，农村集中供水和自来水普及率分别达到85%和80%。
王爱祖表示，在都市功能核心区，重点加强防洪保安和城市应急水源工程建设，构建以长江、嘉陵江提水为骨干，以完善区域多水源建设为备用补充，输水管网互联互通互济的供水格局；以有效防御50-100年一遇以上洪水为目标，加强都市功能核心区的城市防洪建设；强化节水型社会建设，严格保护城市河库水系。
在渝东南生态保护发展区，优先保护和修复生态环境，因地制宜建设一批中小型水库工程，形成以中小型水库为主，江河提水工程为辅，各区县相对独立的供水格局；全面实施农村饮水安全巩固提升工程，解决好贫困人口、高山生态移民和旅游景区的饮水安全问题；加强重要支流、中小河流治理，加快推进山洪灾害防治；积极推进小型农田水利建设，保护城镇重要饮用水水源地，加强水土保持与石漠化治理，改善贫困地区生产生活条件。
王爱祖还提到，在水生态方面，加快水生态文明建设，以三峡库区水生态保护为重点，加快推进城镇、农村集中式饮用水水源地保护工程和水生态修复工程建设，重要江河水功能区水质达标率达到80%，加快以小流域为单元的水土流失综合治理，新增治理水土流失面积5000平方公里，推进重要江河“河长制”改革，使重要江河“河长制”覆盖率达到85%，推进水生态文明城市和海绵城市建设，加强河库水生态环境保护，着力涵养保护好青山绿水。同时，以深化水利改革为重点，落实最严格水资源管理制度，强化依法治水管水，加强涉水事务管理，推行水利工程“物业化”管理，加快以水利信息化为骨干的行业能力建设，基本建成水管理服务体系。
在重点水源方面，王爱祖表示，将以建设大中型水源工程为骨干，以河库水系连通为纽带，以塘库升级为补充，优化现状水源工程配置格局，提高现状水源工程有效利用水平，切实增加有效供水，提高对水资源在时间和空间上的调控和保障能力；建设渝西水资源配置工程，金佛山、观景口、藻渡3座大型水库，45座中型水库，一批小型水库和引提水及连通工程，新增供水能力15亿立方米。
王爱祖表示，在渝东北生态涵养发展区，按照生态优先、绿色发展的要求，把水生态文明建设、三峡库区水生态保护摆在突出位置，加强“万开云”板块水利基础设施建设，完善以中小型蓄水工程为主，蓄引提工程相结合的供水格局，加快实施农村饮水安全巩固提升工程，提升城乡供水保障能力；加强中小河流治理，加快推进山洪灾害防治；适度发展灌溉面积，加强小型农田水利建设，提高农田灌溉率；以三峡库区及周边为重点开展水源涵养、水土保持建设和库区消落带治理，保护重要饮用水水源地；改善水生态环境，打造沿江绿色生态走廊，建设长江上游重要生态屏障。
王爱祖说，在防洪减灾方面，以长江干流及主要支流、中小河流治理为重点，加快推进城镇河段防洪工程建设，加强山洪灾害工程措施与非工程措施建设，让全市城镇建成区、人口聚居区、产业集聚区等重要区域防洪基本达标，城市防洪达标率达到93%，乡镇防洪达标率达到90%，提高山洪灾害易发区监测预警预报设施覆盖率。
在农田灌溉方面，以1000万亩高标准农田和1000万亩标准化现代特色效益农业产业基地建设为重点，加快实施大中型灌区续建配套与节水改造和小型农田水利建设，加强现代农业示范区等节水减排工程建设，在已完成7.8万口山坪塘整治的基础上，再整治山坪塘5.3万口，进一步增加有效灌溉面积和节水灌溉面积，新增有效灌溉面积150万亩（其中节水灌溉面积60万亩），努力实现农田“旱能灌、涝能排”和“少灌水、高利用、低排放”。
在城市发展新区，以均衡城市发展与协调水资源水环境承载能力，支撑重点区域开发为主线，以大中型水库为龙头，长江等提水工程为骨干，实施一批塘库升级、互联互通互济工程，构建河库相连、多源互补的城乡供水保障体系；积极推进城乡供水一体化，加快实施农村饮水安全巩固提升工程；处理好农业灌溉与其它行业用水之间的关系，以灌区续建配套与节水改造为基础，合理发展新灌区，重点发展高效节水灌溉示范区；加强骨干河道综合治理和城区防洪工程建设；加强重要饮用水源地保护与监测，加大城区和工业园区节水减排和污水回用力度，着力推进节水型产业体系建设，保护和恢复重要湿地，改善河库生态环境，不断提升水利保障能力。
王爱祖说，深化拓展五大功能区域发展战略，要在促发展上下功夫。“十三五”时期，重庆水利将按照习近平总书记“节水优先、空间均衡、系统治理、两手发力”新时期水利工作方针，以水利需求和问题为导向，以推进水利基础设施网络建设为主线，以依法治水为保障，突出民生水利和改革发展两大任务，加快建设重点水源、农村供水、防洪减灾、农田灌溉、水生态、管理能力六大工程，着力推进供给侧结构性改革补齐水利短板，基本解决工程性缺水、城镇防洪减灾、农村饮水安全、山坪塘整治、城市应急水源、水管理服务能力较弱六大问题。
在都市功能拓展区，以水资源高效利用为主线，加快推进观景口水库等水源工程建设，构建以长江、嘉陵江提水为骨干，大中型水库为调蓄的多水源配置格局；加快推进城乡供水一体化，有效提升城市水务管理水平，提高供水安全保障程度；加强城区防洪工程建设，提高防洪减灾能力，构筑水安全保障体系。